Yeni bir gen makası, koronavirüs gibi RNA tabanlı yapıları da manipüle edebilir. Önceki CRISPR/Cas9 yöntemi ise DNA ile sınırlıydı.

New York (ABD). Moleküler biyoloji aracı CRISPR/Cas9 , bilimin son yıllarda ürettiği en büyük yeniliklerden biri olarak kabul ediliyor. Gen makası denilen aletle, canlıların genetik materyalleri eskisinden çok daha hassas bir şekilde manipüle edilebiliyor. Böylece, örneğin tıbbın , yeni tedavi seçenekleri türetmek için gerekli olan, hastalıkların genleri hakkında temel bilgileri elde etmesi mümkündür. Bununla birlikte, CRISPR/Cas9 gen makası da tarımsal verimi artırmaya yöneliktir. Ayrıca Rusya’da bebekler üzerinde gen deneyleri yapılması planlanıyor ve bu da Alman Etik Konseyi açısından da tartışmalı.

Bununla birlikte, şimdiye kadar, gen makası yalnızca DNA’yı manipüle edebildi, CRISPR/Cas9 ise, örneğin yakın zamanda kodu çözülmüş koronavirüste meydana gelen RNA’yı değiştiremedi. Bu nedenle, birçok virüsün daha iyi anlaşılması ve aynı zamanda insan hücrelerinde RNA’nın değiştirilebilmesi için RNA’yı da inceleyebilen ve onlara saldırabilen başka bir geliştirme gereklidir.

Yeni gen makası RNA için de çalışıyor

New York Genom Merkezi’nden (NYGC) ve New York Üniversitesi’nden (NYU) bilim adamları, RNA ile de çalışan ünlü Nature Biotechnology dergisinde CRISPR yönteminin daha da geliştirilmesini sundular. Hans-Herrmann Wessels liderliğindeki araştırmacılar, Cas9 enziminin aksine sadece DNA’yı değil, RNA’yı da kesebilen, yakın zamanda keşfedilen CRISPR enzimi Cas13’ü temel aldılar.

Bilim adamları daha sonra kesme enzimini, gen makasının hücrelerin RNA düzeyinde taranmasını sağladığı bir tarama platformu geliştirmek için kullandılar. Yeni yöntem, gen makası kullanılarak genomdaki birçok yerin eş zamanlı olarak incelenmesini sağlıyor.

RNA süreçlerinin daha iyi anlaşılması

Bilim adamları, yeni tarama teknolojisinin RNA düzenleme süreçlerini daha iyi anlamalarını sağlayacağını umuyor. Bununla birlikte Cas13, tıp için yeni terapötik yaklaşımlar da sağlamalıdır, çünkü RNA’daki bir değişiklik gen ekspresyonunu etkileyebilir. Diğer şeylerin yanı sıra, genomu kalıcı olarak değiştirmeden bireysel genleri kapatmak mümkündür.

Çalışmanın ortak yazarı Neville Sanjana, “RNA hedefli Cas13 enzimlerinin moleküler biyoloji ve tıbbi uygulamalar için büyük önemi olacağını” belirtiyor. buna dayalı.” Kılavuz RNA’lar, gen makasının kendi hedeflerini tanıması için ihtiyaç duyduğu bölümlerdir.

Hassas kılavuz RNA gerekli

RNA yapısını manipüle ederken hatalardan kaçınmak için, kılavuz RNA mümkün olduğu kadar kesin olmalıdır. Bilim adamları, hangi RNA dizilerinin kullanılabileceğini bulmak için farklı kılavuz RNA’ları karşılaştırmayı mümkün kılan bir tarama yöntemi kullandılar. Daha sonra sonuçlardan en etkili varyantları tahmin etmeyi mümkün kılan bir model geliştirildi.

Bilim adamları, genellikle gen düzenlemede hatalara yol açan kilit alanları belirlemeyi başardılar. Ek olarak, kılavuz RNA’nın, yöntem için RNA’nın diğer bölgelerine göre önemli ölçüde daha önemli olan bölgeleri belirlendi. Gelecekte, bu temel bilgi, Cas13 enzimine dayalı gen makası için mümkün olan en kesin kılavuz RNA’ları geliştirmek için kullanılacaktır.

Cas13 enzimi ile koronavirüs analizi

Çalışmanın yazarları ayrıca, koronavirüsün teşhisi ve tedavisi için en uygun kılavuz RNA’ları belirlemek için mevcut tahmin modelini kullandılar. New York’ta korona bulaşmış bir hasta bazında gerçekleştirilen RNA analizinin sonuçlarına projenin internet sitesinden ücretsiz olarak ulaşılabiliyor.